丘脑下部分泌促性腺激素释放激素，使脑垂体前叶分泌促性腺激素，起调节卵巢功能和维持月经的作用。丘脑下部的功能失调可影响垂体，进而影响卵巢引起闭经。引起丘脑下部功能失调的原因较多，分述如下：①精神神经因素：精神紧张、恐惧、忧虑、精神病如精神分裂症、环境改变、地区迁移以及寒冷刺激等，都可引起中枢神经与丘脑下部间的功能紊乱，一般卵巢排卵功能首先发生障碍，然后卵泡成熟发生障碍而致闭经。因盼子心切或恐惧妊娠等精神因素而致的假孕，也属于这种范畴。②消耗性疾病：胃肠道功能紊乱所引起的营养不良、重度肺结核、严重贫血等，都可通过丘脑下部影响脑垂体功能，导致闭经。③肥胖生殖无能性营养不良症：丘脑下部病变如颅咽管瘤，可引起闭经、肥胖、生殖器官及第二性征发育不全。④药物抑制综合征：少数妇女在注射长效避孕针或口服避孕药后可继发闭经，这是由于丘脑下部对药物的抑制反应特别敏感引起的，这种抑制常是可逆的，一般在停药后3～6个月内能自然恢复。⑤闭经泌乳综合征：患者除闭经外尚有不随意的持续性乳汁分泌及内生殖器萎缩。⑥多囊卵巢综合征：以20～30岁年轻女性为多见，表现为闭经、不孕、多毛及肥胖。⑦其他内分泌腺影响：肾上腺、甲状腺、胰腺等功能紊乱时也可影响月经。如柯兴氏综合症、阿狄森氏病、甲状腺功能减退、糖尿病等，都能通过丘脑下部影响垂体功能而引起闭经。此外，先天性肾上腺生殖综合症也可导致原发性闭经。